Kiris adı, şehrin tarihi boyunca kullanılmıştır. Şehir, Romalılar, Bizanslılar, Selçuklular ve Osmanlılar tarafından yönetilmiştir.

1923 yılında, Cumhuriyetin ilanından sonra, şehrin adı Kilis olarak değiştirilmiştir. Bu isim, şehrin eski adı olan Kiris kelimesinin Türkçe telaffuzudur.

Kiris adı, iki kelimeden oluşmaktadır. Kir, "düz" anlamına gelmektedir. Is ise, "yer" anlamına gelmektedir.

Kilis, adını, şehrin bulunduğu bölgedeki düzlükten almıştır. Düzlük, şehrin önemli bir özelliğidir.

Kilis, 1995 yılında Gaziantep ilinden ayrılarak il olmuştur.