Bazı araştırmacılara göre, "Amisos" kelimesi, yerel bir dilden türemiş olabilir ve "balıkçıların yeri" veya "balıkçı kasabası" gibi anlamlara gelebilir. Bunun nedeni, Samsun'un bir liman şehri olması ve balıkçılığın önemli bir faaliyet olmasıdır.
Diğer bir teori ise "Amisos" kelimesinin, Pontus bölgesinde yaşamış yerli halk olan Leleglerden türemiş olabileceğidir. Bu teoriye göre, Amisos kelimesi Lelegce bir köken olup, "birlikte üzgünler" anlamına gelir.
Samsun'un tarih boyunca farklı kültürlerin etkisi altında kalmasıyla birlikte, bu farklılıklar şehrin adının kökenini de belirsizleştirmiştir. Ancak günümüzde "Samsun" olarak bilinen şehir, tarihi Amisos kentinin modern adıdır.
